Le Territoire de Belfort bénéficie d'une desserte ferroviaire particulièrement bien ajustée. Les TER assurent des liaisons cadensées avec les départements et régions voisines pour les trajets quotidiens. Première ligne à grande vitesse interrégionale, le TGV Rhin-Rhône relie le Territoire aux métropoles françaises et européennes. Enfin, la ligne TER Belfort-Delle-Bienne, avec correspondance à la gare Belfort-Montbéliard TGV, offre de nouvelles opportunités de déplacement, tant pour les transfrontaliers que pour les touristes.